新计算法展示四种治类风关药的不同效果和它们怎么影响小鼠的身体变化

一种新的计算工具展示了四种类风湿性关节炎药物之间的关键差异及其对小鼠生物通路的影响。

摘要：由希腊 biomedcode hellas sa 的 niki karagianni 和她的团队在《PLOS 计算生物学》上发布了一种创新的方法，旨在分析四种类风湿性关节炎药物对小鼠生物通路的具体作用。该研究不仅揭示了这些药物之间的显著差异，还探讨了它们如何影响类风湿性关节炎小鼠模型中的基因表达。此外，研究团队开发了一个全新的计算框架，这个框架未来可以应用于其他疾病的药物详细对比。

引言：类风湿性关节炎是一种长期的炎症性疾病，患者通常会接受针对肿瘤坏死因子（TNF）的药物治疗。尽管多种抗 TNF 药物已被广泛应用并取得一定疗效，但它们在分子层面的具体作用机制仍不完全清楚。为了解决这个问题，karagianni 和她的团队利用了慢性炎症性多关节炎的小鼠模型，分析了接受四种抗 TNF 药物（Remicade、Cimzia、Humira 或 Enbrel）治疗的小鼠的转录组。

方法：研究团队采集了接受药物治疗的小鼠和健康小鼠的关节组织样本，并进行了转录组分析。转录组指的是细胞内所有信使 RNA 分子的集合，反映了哪些基因处于活跃状态。研究人员采用一系列计算步骤来比较这四种药物的效果。

结果：数据分析显示，这四种药物在影响患病小鼠基因表达方面存在之前未被发现的差异。这些差异不仅出现在与关节炎直接相关的基因中，也出现在一些与心血管疾病和其他可能伴随关节炎出现的疾病相关的基因中。研究合作者 christoforos nikolaou 指出：“我们研究中最重要的一项发现是，患病小鼠中有大量基因表达水平下降，这些基因与某些功能和生物通路相关，而这些通路在过去并未受到充分关注。”

这项研究开发的新计算框架有望在未来应用于其他疾病的药物详细比较。为了实现这一目标，研究人员正致力于将该系统转化为一个自动化且独立的软件包。

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